宏转录组测序

宏转录组测序技术(Metatranscriptomic sequencing)通过对特定时期、特定环境样品中所有微生物群落的转录本进行大规模高通量测序,可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。这种技术不仅具有宏基因组技术的全部优点,可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究,还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径,揭示微生物在不同环境压力下的适应机制,探索环境与微生物之间的互作机理。

1、适用范围
(1)医药领域:人体微生物与疾病关系的研究、分子标志和药物靶点的筛选鉴定等;
(2)生态领域:生物互作、微生物制剂的开发、生物代谢调控研究等;
(3)工业领域:微生物活性物质开发、生物能源、环境污染监控与生物修复等。
2、技术路线
3、技术参数
送样要求 RNA:总量 ≥ 4 μg、浓度 ≥ 120 ng/μL、有明显主条带;
 cDNA:必须为双链、总量 ≥ 4 μg、浓度 ≥ 20 ng/μL
平台选择 Illumina PE100/125/150
推荐测序量 5-10G
4、生物信息分析