全基因组甲基化测序

DNA甲基化是一种非常重要的表观遗传修饰方式,参与细胞分化、基因的表达调控、染色体失活、基因组印记等生物学过程和众多疾病的发生发展过程,所以获得全基因组范围内的甲基化信息,对于研究众多生物学过程和疾病的表观遗传机制具有重要意义。所以获得全基因组范围内的甲基化信息,对于研究众多生物学过程和疾病的表观遗传机制具有重要意义。全基因组甲基化测序 (Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) 是将重亚硫酸氢盐处理与高通量测序平台相结合,对有参考基因组物种的 DNA 甲基化状态进行全基因组范围内检测的技术手段

1、技术路线

2、技术参数
样本类型 样本量 样本纯度 周期 备注
DNA DNA:5μg OD260/280=1.8-2.0 并确保DNA无降解,无污染 45-55个工作日 样品保存期间切忌反复 冻融,送样时请使用冰 袋或干冰运输
3、案例解读
scWGBS 揭示胚胎发育,干细胞分化以及癌症基因组甲基化模式
研究背景:细胞异质性问题引发单细胞基因组测序和转录组测序热潮,而存在异质性问题的细胞,其表观基因组又是如何呢。单细胞基因组甲基化测序技术研究人和小鼠多能干细胞在分化过程中基因组甲基化状态。
研究结果:揭示了细胞在分化过程中异质性问题和基因组甲基化现象。

参考文献
Farlik, M. et al. Single-cell DNA methylome Sequencing and bioinformatic inference of epigenomic cell-state dynamics. Cell Rep 10, 1386-1397, doi:10.1016/j.celrep.2015.02.001 (2015).