1、技术路线
2、技术参数
3、技术参数
4、案例解读
RNA-Seq揭示mef/mel(msr(D))介导的大环内酯素对S型肺炎链球菌的抗性调控机制
研究背景：肺炎链球菌和一些革兰氏阴性菌中出现大环内酯素抗性，是因为在mef/mel(msr(D))操纵子上编码外排泵的离散移动基因元件越来越多，但是这种调控机制尚不清楚。
研究结果：研究发现了mef(E)/mel 转录起始，定位了mef(E)/mel 启动子位置以及证明了转录衰减作用作为大环内酯素诱导，mefjie'dao介导的大环内酯素对S型肺炎链球菌的抗性机制。
RNA-Seq转录组分析
参考文献
Chancey, S. T. et al. Transcriptional attenuation controls macrolide inducible efflux and resistance in Streptococcus pneumoniae and in other Gram-positive bacteria containing mef/mel(msr(D)) elements. PLoS One 10, e0116254, doi:10.1371/journal.pone.0116254 (2015).
2、技术参数
3、技术参数
| 样本类型 | 样本量 | 样本纯度 | 周期 | 备注 |
|---|---|---|---|---|
| RNA/菌体 | 菌体样本：5g | OD260/280=1.9-2.2，RIN值≥7，23S:16S≥1.0，确保RNA无降解 | 35-40工作日 | 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输 |
| RNA：1ug |
RNA-Seq揭示mef/mel(msr(D))介导的大环内酯素对S型肺炎链球菌的抗性调控机制
研究背景：肺炎链球菌和一些革兰氏阴性菌中出现大环内酯素抗性，是因为在mef/mel(msr(D))操纵子上编码外排泵的离散移动基因元件越来越多，但是这种调控机制尚不清楚。
研究结果：研究发现了mef(E)/mel 转录起始，定位了mef(E)/mel 启动子位置以及证明了转录衰减作用作为大环内酯素诱导，mefjie'dao介导的大环内酯素对S型肺炎链球菌的抗性机制。
RNA-Seq转录组分析
参考文献
Chancey, S. T. et al. Transcriptional attenuation controls macrolide inducible efflux and resistance in Streptococcus pneumoniae and in other Gram-positive bacteria containing mef/mel(msr(D)) elements. PLoS One 10, e0116254, doi:10.1371/journal.pone.0116254 (2015).