微生物基因组重测序

微生物重测序能够快速解析菌株之间的变异信息。利用高通量测序技术,对一个物种的全基因组进行测序,并与近缘参考基因组进行比对,开发海量的SNP,InDel等分子标记,系统全面的检测菌株之间的基因变异信息。同时还可进一步进行物种进化、种群特征、选择压力等深入研究。

1、产品类型
(1) 有参考基因组的菌株或真菌;
(2) 选择具有代表性的个体。
2、技术路线

3、技术参数
产品 测序平台 测序策略 检测内容 项目周期
细菌重测序 Illumina Hiseq PE150文库 100X
PE150文库 30X
SNP、SV、InDel 25天
真菌重测序 Illumina Hiseq SNP、SV、InDel、CNV 25天
4、生物信息分析