蛋白质组学服务

蛋白质组是指一个生物体可以表达的所有蛋白质的合集。蛋白质组学是以蛋白质组的为研究对象,研究不同的蛋白质之间的相互作用,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律的一门学科。蛋白质作为生命活动的物质承担者和生理功能的执行者,研究蛋白质学对阐明生命体的变化机制具有重要作用。

1、产品简介
蛋白质组学核心方法主要包括蛋白质组学定性分析和定量分析两大类,其中定量蛋白质组学是蛋白质组学技术中的核心。



1)定性蛋白质组学
蛋白质定性分析是指利用质谱法对样品中蛋白质的种类进行分析确定。
- 蛋白质胶点/胶条分析
蛋白胶点胶条鉴定是目前使用最广泛的定性蛋白质组学研究手段,用双向电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离蛋白质混合物,收集目的蛋白质胶点和胶条,经胶内酶解后用于质谱分析以确定样品中蛋白质的种类。


- 蛋白全谱分析
蛋白全谱分析,也称为蛋白质组分分析,是以组织、细胞或血液、体液等复杂样本为研究对象,采用高效液相色谱和质谱技术,鉴定样本中尽可能多的肽段和蛋白质,是高通量蛋白鉴定分析的有力工具。


2)定量蛋白质组学
蛋白质定量分析是指利用质谱法对样品中蛋白质的含量进行分析确定,目前较主流的定量蛋白质组学方法有以下几种:
- SILAC标记定量蛋白质组学
SILAC即细胞培养条件下稳定同位素标记技术(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture,SILAC),其技术原理是在细胞培养基中加入稳定同位素标记的必需氨基酸,通过细胞的正常代谢,使新合成的蛋白带上稳定同位素标签。然后将蛋白质等量混合后进行分离和质谱鉴定,根据一级质谱图中同位素峰图的面积比较进行相对定量。


- iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组学
iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组研究是对样本中的蛋白质进行同位素标记,然后进行串联质谱分析,可同时比较8种或10种不同样品中蛋白质的相对含量。 iTRAQ和TMT技术只是生产商不同, 标记肽段的原理基本上是一样的。


- Label free非标记定量蛋白质组学
Label free非标记定量蛋白质组学是一种不使用任何标记,直接对蛋白质肽段进行质谱分析和定量的技术,无需使用昂贵的稳定同位素标签,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样本中相应肽段的信号强度,就能对相应的蛋白质进行相对定量。


- DIA定量蛋白质组学
DIA数据非依赖采集(Data independent acquisition,DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式,相对于传统的DDA数据依赖的采集模式,改进后的DIA模式能够高效测定复杂样品中相对低丰度的蛋白分子,极大地提高了定量分析的可信度。


- PRM靶向蛋白组学
PRM平行反应监测(parallel Reaction Monitoring,PRM),常被称为“质谱领域的WB”,是目前靶向蛋白质组学数据采集的主流方法,通过对目标肽段或蛋白质进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质的相对或绝对定量,或者用于验证大规模蛋白质组学的结果。


不同定量蛋白组学技术比较:


2、应用方向